ERP與MES的定位不同，傳統ERP的角色定位在企業計劃，主要針對流程來管理，其管理的資料以週/天為時間週期。當ERP下達的工單到生產現場後，ERP無法對現場進行即時有效管控，出現工單執行過程中的 “訊息黑洞”。

MES系統定位於作業執行層面，它接轉ERP下達的工單，並即時發佈到產線，再透過現場的資料回饋蒐集，直接對現場操作人員和工廠管理人員提供生產支援。其管理的資料以現在/下一個小時為時間週期，為管理人員提供即時訊息來進行決策。

ERP與MES管理的功能範圍不同 ERP主要管理採購/財務/銷售/生產訂單管理/發運管理/成品倉儲計劃控制等計劃層面功能。 MES主要提供工廠的工單派發/製程防錯/產品譜系/SPC統計製程管制/整體設備效率OEE分析/製程追溯等執行層面的功能。

ERP與MES系統有不同的技術要求 ERP主要處理資源規劃，資訊量小，不需要和底層硬體相互連動，易於採用集中的方式管理。更重要的是ERP在導入時，計劃的流程相對固定。而MES的資訊粒度小，資料量大，和工廠的控制、管理流程、自動化程度密切相關，不同企業導入時差異也很大，且需要不斷適應工廠管理模式的變革，因此更需要系統的軟實力和對集團推廣的支援能力。另外，MES系統直接記錄生產過程中所生成的即時資訊，因此在系統的可靠性和穩定性方面比ERP要求更高。